漳州东站目前有24条列车运营线路经过，主要指标包括列车车次、始发站终点站名称、到达时间、发车时间、累计用时、累计距离等。
| 车次 | 类型 | 始发站 | 始发时间 | 漳州东站 到达时间 |
漳州东站 发车时间 |
终点站 | 到达时间 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| K298/K299 | 空调快速 | 厦门 | 17:13 | 18:16 | 18:21 | 广州东 | 07:23 |
| K297/K300 | 空调快速 | 广州东 | 19:00 | 第2日07:10 | 07:13 | 厦门 | 08:18 |
| N536 | 空调快速 | 厦门 | 08:28 | 09:18 | 09:21 | 三明 | 14:54 |
| N535 | 空调快速 | 三明 | 15:40 | 20:57 | 21:05 | 厦门 | 22:11 |
| N506/N507 | 空调快速 | 厦门 | 18:50 | 19:40 | 19:43 | 南昌 | 11:36 |
| K242/K243 | 空调快速 | 西安 | 20:01 | 第3日05:23 | 05:27 | 厦门 | 06:22 |
| K241/K244 | 空调快速 | 厦门 | 17:36 | 18:26 | 18:30 | 西安 | 06:15 |
| K198/K199 | 空调快速 | 厦门 | 22:14 | 23:15 | 23:19 | 松江 | 21:37 |
| 2026 | 空调普快 | 厦门 | 21:00 | 21:54 | 21:57 | 合肥 | 03:20 |
| 2025 | 空调普快 | 蚌埠 | 12:37 | 第2日16:32 | 16:37 | 厦门 | 17:33 |
| 2249 | 空调普快 | 杭州 | 09:50 | 第2日08:42 | 08:48 | 厦门 | 10:11 |
| N510/N511 | 空调快速 | 龙岩 | 18:05 | 21:49 | 21:58 | 厦门 | 23:00 |
| N509/N512 | 空调快速 | 厦门 | 07:55 | 08:45 | 08:49 | 龙岩 | 12:29 |
| N545/N548/N581 | 空调快速 | 武夷山 | 18:04 | 第2日05:41 | 05:45 | 厦门 | 06:38 |
| K197 | 空调快速 | 松江 | 19:07 | 第2日15:45 | 15:49 | 厦门 | 16:55 |
| N505/N508 | 空调快速 | 南昌 | 18:23 | 第2日10:36 | 10:41 | 厦门 | 11:42 |
| 5210 | 普快 | 厦门 | 14:56 | 15:46 | 15:51 | 景德镇 | 09:19 |
| 5209 | 普快 | 景德镇 | 11:45 | 第2日04:38 | 04:42 | 厦门 | 05:32 |
| 2250 | 空调普快 | 厦门 | 10:20 | 11:10 | 11:14 | 杭州 | 08:00 |
| N546/N547 | 空调快速 | 厦门 | 19:06 | 20:09 | 20:14 | 武夷山 | 08:15 |
| L588/L589 | 普快 | 厦门 | 19:34 | 20:24 | 20:27 | 吉安 | 08:44 |
| L587 | 普快 | 吉安 | 15:01 | 第2日05:08 | 05:12 | 厦门 | 06:02 |
| 2521 | 空调普快 | 南京西 | 22:08 | 第3日03:38 | 03:48 | 厦门 | 05:02 |
| K307 | 空调快速 | 北京西 | 11:57 | 第2日18:26 | 18:29 | 厦门 | 19:32 |
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