福州站目前有32条列车运营线路经过，主要指标包括列车车次、始发站终点站名称、到达时间、发车时间、累计用时、累计距离等。
| 车次 | 类型 | 始发站 | 始发时间 | 福州站 到达时间 |
福州站 发车时间 |
终点站 | 到达时间 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| K321/K324 | 空调快速 | 合肥西 | 18:35 | 第2日12:34 | 12:34 | 福州 | 12:34 |
| K322/K323 | 快速 | 福州 | 14:02 | 14:02 | 14:02 | 合肥西 | 08:39 |
| K29/K32 | 快速 | 洛阳 | 14:08 | 第2日14:26 | 14:26 | 福州 | 14:26 |
| 2001 | 空调普快 | 南京西 | 11:45 | 第2日11:34 | 11:34 | 福州 | 11:34 |
| 2002 | 普快 | 福州 | 11:08 | 11:08 | 11:08 | 南京西 | 09:15 |
| K163 | 空调快速 | 嘉兴 | 13:32 | 第2日06:25 | 06:25 | 福州 | 06:25 |
| K164 | 快速 | 福州 | 15:12 | 15:12 | 15:12 | 嘉兴 | 06:53 |
| K68/K69 | 空调快速 | 福州 | 14:29 | 14:29 | 14:29 | 四方 | 09:05 |
| K67/K70 | 空调快速 | 四方 | 19:05 | 第3日09:12 | 09:12 | 福州 | 09:12 |
| K46 | 空调快速 | 福州 | 19:19 | 19:19 | 19:19 | 北京 | 05:07 |
| K45 | 空调快速 | 北京 | 11:45 | 第2日21:59 | 21:59 | 福州 | 21:59 |
| 1682/1683 | 空调普快 | 福州 | 17:38 | 17:38 | 17:38 | 长沙 | 11:06 |
| 1681/1684 | 空调普快 | 长沙 | 21:00 | 第2日13:54 | 13:54 | 福州 | 13:54 |
| K389/K392 | 空调快速 | 福州 | 11:37 | 11:37 | 11:37 | 成都 | 05:18 |
| N550 | 空调快速 | 福州 | 08:32 | 08:32 | 08:32 | 武夷山 | 14:35 |
| N549 | 空调快速 | 武夷山 | 15:30 | 21:44 | 21:44 | 福州 | 21:44 |
| N540/N541 | 快速 | 福州 | 10:08 | 10:08 | 10:08 | 龙岩 | 20:38 |
| N539/N542 | 快速 | 龙岩 | 08:37 | 20:12 | 20:12 | 福州 | 20:12 |
| N538 | 空调快速 | 福州 | 09:14 | 09:14 | 09:14 | 南平 | 12:28 |
| N537 | 空调快速 | 南平 | 13:20 | 17:01 | 17:01 | 福州 | 17:01 |
| N516/N517 | 空调快速 | 南昌 | 20:36 | 第2日06:12 | 06:12 | 福州 | 06:12 |
| N515/N518 | 空调快速 | 福州 | 21:00 | 21:00 | 21:00 | 南昌 | 06:42 |
| K636/K637 | 空调快速 | 深圳 | 21:06 | 第2日15:10 | 15:10 | 福州 | 15:10 |
| K635/K638 | 空调快速 | 福州 | 21:16 | 21:16 | 21:16 | 深圳 | 15:11 |
| K524/K525 | 空调快速 | 福州 | 12:36 | 12:36 | 12:36 | 武昌 | 05:24 |
| K523/K526 | 空调快速 | 武昌 | 16:45 | 第2日10:32 | 10:32 | 福州 | 10:32 |
| K476/K477 | 空调快速 | 贵阳 | 16:34 | 第2日20:58 | 20:58 | 福州 | 20:58 |
| K475/K478 | 空调快速 | 福州 | 09:43 | 09:43 | 09:43 | 贵阳 | 13:45 |
| 1004/1005 | 空调普快 | 福州 | 17:22 | 17:22 | 17:22 | 重庆北 | 08:17 |
| 1003/1006 | 空调普快 | 重庆北 | 12:56 | 第3日05:16 | 05:16 | 福州 | 05:16 |
| Z59 | 空调直达特快 | 北京西 | 17:38 | 第2日13:16 | 13:16 | 福州 | 13:16 |
| Z57/Z60 | 空调直达特快 | 福州 | 16:02 | 16:02 | 16:02 | 北京西 | 11:38 |
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