仪征站目前有4条列车运营线路经过，主要指标包括列车车次、始发站终点站名称、到达时间、发车时间、累计用时、累计距离等。
| 车次 | 类型 | 始发站 | 始发时间 | 仪征站 到达时间 |
仪征站 发车时间 |
终点站 | 到达时间 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5096/5097 | 普快 | 南京 | 14:08 | 15:11 | 15:14 | 南通 | 18:06 |
| 5095/5098 | 普快 | 南通 | 08:28 | 11:22 | 11:24 | 南京 | 12:28 |
| T782/T783 | 空调特快 | 上海 | 14:39 | 19:37 | 19:50 | 扬州 | 20:05 |
| T781/T784 | 空调特快 | 扬州 | 08:28 | 08:43 | 08:45 | 上海 | 13:22 |
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