盐城站目前有18条列车运营线路经过，主要指标包括列车车次、始发站终点站名称、到达时间、发车时间、累计用时、累计距离等。
| 车次 | 类型 | 始发站 | 始发时间 | 盐城站 到达时间 |
盐城站 发车时间 |
终点站 | 到达时间 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| T155/T158 | 空调特快 | 哈尔滨 | 09:55 | 第2日06:41 | 06:44 | 泰州 | 08:29 |
| T156/T157 | 空调特快 | 泰州 | 18:02 | 19:47 | 19:49 | 哈尔滨 | 17:11 |
| 5100 | 普快 | 南通 | 09:14 | 11:26 | 11:32 | 淮安 | 13:19 |
| 5099 | 普快 | 淮安 | 14:15 | 16:12 | 16:15 | 南通 | 18:28 |
| K417/K420 | 空调快速 | 兰州 | 09:51 | 第2日10:38 | 10:43 | 泰州 | 12:38 |
| K418/K419 | 空调快速 | 泰州 | 16:57 | 18:37 | 18:44 | 兰州 | 18:32 |
| K563/K566 | 空调快速 | 太原 | 13:30 | 第2日07:02 | 07:05 | 南通 | 09:05 |
| K245/K248 | 空调快速 | 扬州 | 10:35 | 13:50 | 13:53 | 成都 | 22:28 |
| K246/K247 | 空调快速 | 成都 | 21:15 | 第3日03:53 | 03:58 | 扬州 | 06:28 |
| K425/K428 | 空调快速 | 南京 | 22:25 | 第2日02:42 | 02:47 | 连云港东 | 09:15 |
| K426/K427 | 空调快速 | 连云港东 | 08:18 | 14:19 | 14:23 | 南京 | 20:02 |
| K413/K416 | 空调快速 | 四方 | 09:00 | 17:13 | 17:25 | 扬州 | 20:50 |
| K414/K415 | 空调快速 | 扬州 | 09:02 | 12:56 | 13:03 | 四方 | 21:06 |
| 5079 | 普快 | 淮安 | 08:24 | 10:07 | 10:18 | 南通 | 12:41 |
| 5080 | 普快 | 南通 | 14:54 | 17:18 | 17:22 | 淮安 | 19:10 |
| Z52 | 空调直达特快 | 南通 | 19:06 | 20:59 | 21:01 | 北京 | 07:36 |
| Z51 | 空调直达特快 | 北京 | 19:20 | 第2日05:47 | 05:49 | 南通 | 07:42 |
| K564/K565 | 空调快速 | 南通 | 13:04 | 15:05 | 15:09 | 太原 | 09:12 |
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