连云港东站目前有24条列车运营线路经过，主要指标包括列车车次、始发站终点站名称、到达时间、发车时间、累计用时、累计距离等。
| 车次 | 类型 | 始发站 | 始发时间 | 连云港东站 到达时间 |
连云港东站 发车时间 |
终点站 | 到达时间 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2525/2528 | 空调普快 | 连云港东 | 17:28 | ---- | 17:28 | 上海 | 05:32 |
| 2526/2527 | 空调普快 | 上海 | 06:27 | 18:59 | 18:59 | 连云港东 | 18:59 |
| 1502/1503 | 空调普快 | 北京西 | 08:58 | 22:17 | 22:17 | 连云港东 | 22:17 |
| 1441/1444 | 普快 | 连云港东 | 15:52 | 15:52 | 15:52 | 汉口 | 05:53 |
| 1442/1443 | 普快 | 汉口 | 19:29 | 第2日07:42 | 07:42 | 连云港东 | 07:42 |
| 1085/1088 | 普快 | 连云港东 | 10:39 | 10:39 | 10:39 | 乌鲁木齐 | 11:15 |
| 1552/1553 | 普快 | 连云港东 | 16:30 | 16:30 | 16:30 | 太原 | 11:24 |
| 1551/1554 | 普快 | 太原 | 19:42 | 第2日13:45 | 13:45 | 连云港东 | 13:45 |
| 5049 | 普快 | 徐州 | 06:45 | 09:31 | 09:31 | 连云港东 | 09:31 |
| 5047 | 空调普快 | 徐州 | 20:32 | 23:26 | 23:26 | 连云港东 | 23:26 |
| 5006 | 空调普快 | 连云港东 | 22:47 | 22:47 | 22:47 | 徐州 | 01:21 |
| 7052 | 普慢 | 连云港东 | 06:56 | 06:56 | 06:56 | 徐州 | 12:21 |
| 7051 | 普慢 | 徐州 | 15:30 | 20:42 | 20:42 | 连云港东 | 20:42 |
| 5048 | 空调普快 | 连云港东 | 10:10 | 10:10 | 10:10 | 徐州 | 13:12 |
| 5029 | 空调普快 | 徐州 | 07:29 | 11:02 | 11:02 | 连云港东 | 11:02 |
| 5005 | 空调普快 | 徐州 | 13:42 | 16:53 | 16:53 | 连云港东 | 16:53 |
| 5002 | 空调普快 | 连云港东 | 20:18 | 20:18 | 20:18 | 徐州 | 00:10 |
| 5001 | 空调普快 | 徐州 | 13:00 | 16:17 | 16:17 | 连云港东 | 16:17 |
| 1501/1504 | 空调普快 | 连云港东 | 17:57 | 17:57 | 17:57 | 北京西 | 07:40 |
| 1086/1087 | 普快 | 乌鲁木齐 | 21:52 | 第3日21:44 | 21:44 | 连云港东 | 21:44 |
| K425/K428 | 空调快速 | 南京 | 22:25 | 第2日09:15 | 09:15 | 连云港东 | 09:15 |
| K426/K427 | 空调快速 | 连云港东 | 08:18 | 08:18 | 08:18 | 南京 | 20:02 |
| 1148/1149 | 普快 | 宝鸡 | 16:19 | 第2日09:49 | 09:49 | 连云港东 | 09:49 |
| 1147/1150 | 普快 | 连云港东 | 17:43 | 17:43 | 17:43 | 宝鸡 | 10:07 |
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