祁东站目前有18条列车运营线路经过，主要指标包括列车车次、始发站终点站名称、到达时间、发车时间、累计用时、累计距离等。
| 车次 | 类型 | 始发站 | 始发时间 | 祁东站 到达时间 |
祁东站 发车时间 |
终点站 | 到达时间 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| K150 | 空调快速 | 湛江 | 23:24 | 第2日13:21 | 13:29 | 嘉兴 | 04:44 |
| K538 | 空调快速 | 南宁 | 11:16 | 22:50 | 22:53 | 嘉兴 | 14:01 |
| K156 | 空调快速 | 昆明 | 08:18 | 第2日15:32 | 15:36 | 南京西 | 10:30 |
| K537 | 空调快速 | 嘉兴 | 17:50 | 第2日09:37 | 09:39 | 南宁 | 20:42 |
| K149 | 空调快速 | 嘉兴 | 09:47 | 第2日03:10 | 03:13 | 湛江 | 16:54 |
| 2513 | 普快 | 长沙 | 18:38 | 22:11 | 22:13 | 湛江 | 13:07 |
| 1561 | 空调普快 | 武昌 | 15:54 | 23:19 | 23:22 | 湛江 | 14:35 |
| 1562 | 空调普快 | 湛江 | 11:23 | 第2日01:45 | 01:47 | 武昌 | 00:00 |
| 1558 | 空调普快 | 南宁 | 19:01 | 第2日07:01 | 07:04 | 南昌 | 16:01 |
| 1557 | 空调普快 | 南昌 | 17:22 | 第2日02:33 | 02:36 | 南宁 | 13:22 |
| K155 | 空调快速 | 南京西 | 16:25 | 第2日11:46 | 11:48 | 昆明 | 22:03 |
| 2514 | 普快 | 湛江 | 17:56 | 第2日08:40 | 08:43 | 长沙 | 00:00 |
| N638/N639 | 空调快速 | 肇庆 | 21:35 | 第2日06:33 | 06:35 | 娄底 | 11:47 |
| N637/N640 | 空调快速 | 娄底 | 16:20 | 21:26 | 21:29 | 肇庆 | 07:56 |
| 5380/5381 | 普快 | 张家界 | 18:02 | 第2日04:51 | 04:54 | 衡阳 | 05:47 |
| 5377 | 普快 | 长沙 | 12:42 | 16:12 | 16:14 | 永州 | 17:47 |
| 5378 | 普快 | 永州 | 09:08 | 10:47 | 11:00 | 长沙 | 14:56 |
| 5379/5382 | 普通列车 非空调车 | 衡阳 | 18:29 | 19:34 | 19:41 | 张家界 | 06:58 |
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